A parte administrativa do conselho conta com uma diretoria eleita pelos membros dos grupos espíritas que são filiados ao conselho. A diretoria tem a função de assumir os cargos oficiais conforme as leis Holandesas. Os membros da diretoria do CEH trabalham como voluntários. Esta é formada da seguinte maneira:
- Presidente
- Tesoureiro
- Secretário
Para estruturar melhor seu trabalho o CEH criou comissões que focam áreas específicas, neste momento temos as seguintes comissões:
- Comunicações
- Doutrinária
- Evangelização infanto-juvenil
- Traduções
- Arquivos
- Eventos
A diretoria do conselho se reúne a cada dois meses juntamente com os coordenadores das comissões. Os líderes de todos os grupos que são membros da CEH e dos grupos que são apoiados pelo CEH são convidados a participar nessas reuniões trazendo assim a sua contribuição e sugestões para o crescimento do espiritismo na Holanda. Eles podem contribuir com idéias e compartilhar as decisões.
Durante as reuniões da diretoria do conselho são discutidas também as necessidades e dificuldades dos grupos.